企业为个人建立商业性补充保险或者年金时都应计算缴纳个人所得税，但其计算方法明显不同。
（一）商业保险与个人当月工资薪金所得合并适用税率
根据《财政部国家税务总局关于个人所得税有关问题的批复》（财税[2005]94号）相关规定，企业为职工购买商业性补充保险，应在办理投保手续时作为个人所得税的“工资、薪金所得”项目，按税法规定缴纳个人所得税，即：为职工建立商业补充保险时，企业缴费部分并入个人当月工资薪金所得计算缴纳个人所得税。
（二）年金单独适用税率
计算方法上年金与普通的补充保险或者其他商业保险不同之处在于其适用税率的选择。
年金应视为个人一个月的工资、薪金，这部分工资并不与正常工资、薪金合并，也不扣除任何费用，而是单独按照“工资、薪金所得”。项目计算当期应纳个人所得税款，因而，年金的特殊算法实际上体现出了国家对于企业建立年金制度的一种鼓励态度。
