【问题】
外贸企业丢失增值税专用发票如何申报出口退税？
【解答】
根据《国家税务总局关于外贸企业丢失增值税专用发票抵扣联出口退税有关问题的通知》（国税函[2010]162号）规定，将外贸企业丢失增值税专用发票申报出口退税分为了两种情况：
一是发票联与抵扣联全部丢失时。根据国税函[2010]162号文件规定，对于外贸企业丢失已开具增值税专用发票发票联和抵扣联的，在增值税专用发票认证相符后，可凭增值税专用发票记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的《丢失增值税专用发票已报税证明单》，经购买方主管税务机关审核同意后，向主管出口退税的税务机关申报出口退税。文件首次明确在丢失已开具增值税专用发票发票联和抵扣联的情况下，通过认证相符记账联可以作为外贸企业申报并计算出口退税的依据。
二是有发票联但抵扣联丢失时。根据国税函[2010]162号文件规定，对于外贸企业只丢失已开具增值税专用发票抵扣联的，在增值税专用发票认证相符后，可凭增值税专用发票发票联复印件向主管出口退税的税务机关申报出口退税。
政策调整的原因主要是增值税专用发票现为发票联、抵扣联、记账联三联，原存根联已不再使用。对此，新政策及时进行了调整与明确。另外，需要注意的一点是，根据《国家税务总局关于调整增值税扣税凭证抵扣期限有关问题的通知》（国税函[2009]617号）规定，自2010年1月1日以后，增值税专用发票等扣税凭证抵扣期限，由90天调整为180天。那么，外贸企业丢失已开具的增值税专用发票（抵扣联或发票联），如还未认证的应在规定期限的180天内及时进行认证，并按上述两类情况的要求办理出口退税的有关事宜。
