《关于全面推进公务用车制度改革的指导意见》指出，对于现有公车采用公开招标评估、拍卖机构，通过公开拍卖等方式公开处置。对于公车处置收入，扣除有关税费后全部上缴中央国库。事业单位、国有企业和国有金融企业车辆处置收入，按国家有关财务管理制度执行。
1.增值税处理
行政事业单位在日常业务活动中，按照预算和经费领报关系从财政部门或上级机关收到的各项拨款，这些收入不需要纳税。
根据增值税的相关规定，“有偿性”是缴税的前提。由于这次公车改革的主体基本为党政机关等非营利的行政事业单位，如果拍卖收入足额缴入财政国库，不需要缴纳增值税。而对于买受人承担的税费，各省市执行不一，若拍卖收入不直接足额上缴财政，公车处置收入应扣除有关税费后全部上缴中央国库。
对于车改拍卖收入，若符合缴纳增值税条件的，应根据财税〔2014〕57号规定，按照简并和统一增值税征收率计算缴纳。
2.所得税处理
根据企业所得税法第七条规定，由于党政机关、行政事业单位等不以营利活动为目的单位，其收入的形式主要靠财政拨款，对这类单位取得的非营利性收入征税没有实际意义。所以，企业所得税对于公车拍卖的处理思想与增值税相同。
