事业单位的一部分债务可以称之为负债，事业单位的负债包括长期借款、短期借款、长期应付款、应缴款项、应付职工薪酬、应付及预收款项等几项内容，所述的每种负债具体的核算过程参考下述内容：
一、短期借款会计分录过程：
借：银行存款
贷：短期借款
支付利息时：
借：其他支出
贷：银行存款
偿还时：
借：短期借款
贷：银行存款
二、应缴款项的会计分录过程：
1.应缴税费事业单位的应缴税费是指事业单位按照税法等规定应缴纳的各种税费，包括营业税、增值税、城市维护建设税、教育费附加、车船税、房产税、城镇土地使用税、企业所得税等。
会计分录：
借：经营支出等
贷：应缴税费
2.应缴国库款事业单位的应缴国库款是指事业单位按规定应缴入国库的款项(应缴税费除外)。
3.应缴财政专户款事业单位的应缴财政专户款是指事业单位按规定应缴入财政专户的款项。
三、应付职工薪酬账务处理过程：
借：事业支出、经营支出等
贷：应付职工薪酬
代扣代缴个人所得税
借：应付职工薪酬
贷：应缴税费
支付职工工资、津贴社会保险和住房公积金
借：应付职工薪酬
贷：银行存款
四、应付及预收款项核算过程：
1.应付票据
事业单位开出、承兑商业汇票时：
借：事业支出、经营支出、存货等
贷：应付票据
支付银行承兑汇票的手续费时：
借：事业支出、经营支出等
贷：银行存款
商业汇票到期时：
借：应付票据
贷：银行存款
2.应付账款无法偿付或债权人豁免偿还的应付账款计入其他收入中。
3.预收账款无法偿付或债权人豁免偿还的预收账款计入其他收入中。
4.其他应付款无法偿付或债权人豁免偿还的其他应付款计入其他收入中。
五、长期借款会计分录过程：
借：银行存款
贷：长期借款
支付利息时：
借：其他支出
贷：银行存款
借：其他支出
贷：银行存款
同时：
借：在建工程
贷：非流动资产基金--在建工程
六、长期应付款账务处理过程：
发生长期应付款时：
借：固定资产、在建工程等
贷：长期应付款
支付长期应付款时：
借：事业支出、经营支出等
贷：银行存款等
同时：
借：长期应付款
贷：非流动资产基金
事业单位负债的核算特点主要包括事业单位代收的各种款项在实际收到但尚未上缴时，应作为负债入账;事业单位借入款项，一般不预计利息支出，实际支付利息时，将其计入事业支出或经营支出等两个方面。
