财务分析与评价的主要对象是财务报表所提供的数据，而报表数据本身是有局限的，其具体表现为：
1、会计报表中的有些数据是通过估计得来的，受会计人员主观因素的影响较大。如采用备抵法核销坏帐，按年末应收帐款余额的3%~5%的比例计提坏帐准备金，计入管理费用：固定资产预计净残值率3%~5%，低于3%或高于5%由企业自主决定并报主管财政机关备案；无形资产与开办费的摊销期限，固定资产的折旧年限等，在不同的企业可能会导致几年甚至十几年的差异。
单一地看，上述这些似乎无关紧要，但每一种估计与企业损益都有直接关系，都会对企业损益产生影响，而损益尤其是净损益往往又是财务分析中最为关注的。
2、会计处理方法的不同，会使不同企业同类报表数据缺乏可比性，从而使财务分析结果有差异。根据现行会计制度的规定，企业的存货发出计价方法，固定资产折旧方法，坏帐的处理方法，对外投资的核算方法，外币报表折算汇率，所得税会计中的核算方法等等，都可以有不同的选择。
如存货发出计价方法有先进先出法、后进先出法、加权平均法、分批实际法等多种方法。即使是两个企业实际经营情况完全相同，不同的方法对期末存货及销售成本水平有不同的影响，因此，财务报表中的有关数据会有所不同，使得两个企业的财务分析发生歪曲。
3、通货膨胀会使资产负债表、损益表中的各项数据严重地歪曲。会计核算以货币计量为基本前提，而币值稳定是货币计量假设的内容之一。
而现实的情况是，通货膨胀普遍存在，币值稳定假设受到严峻的挑战，正如美国通货膨胀会计学家所言：“会计的真实性在很大程度上依靠于货币的真实性，但货币是一个说谎者，它所说的和其实际含义是不相同的。”
从资产负债表来看，由于通货膨胀的存在，对货币性资产而言，实际购买力降低，报表中列示的货币资金与其所体现的实际购买力不符；而实物资产由于受历史成本原则的限制，持续的物价上涨使其现时价值高出原帐面价值，往往越是长时期存放的资产，低估程度越严重；从负债角度看，货币性负债会由于物价的上涨给企业带来利益；而非货币性负债则会使企业造成损失；同时，实收资本等所有者权益项目也是以历史成本核算予以反映的。
因此，由于通货膨胀的存在，资产负债表数据的真实性受到影响是必然的，从而影响对企业的财务分析。
通货膨胀同样影响着损益表的可靠性。由于受会计确认与计量的假设及原则的影响，如权责发生制、配比原则，一方面收入是现时的，而成本则是历史的，在通货膨胀条件下由于资产低估导致成本偏低，因此会使收益虎增。
另外，待摊费用、递延资产所摊销的对象可能是前期、前几期甚至是前十几期的物价水平下的消耗情况，因此必然造成净收益不实。
4、有时财务报告中的数据并不全面，即有表外因素存在，主要表现在：
第一、经营租赁带来的影响。从现行会计制度看，经营租赁的资产不在资产的负债表中反映，因此，从一定程度上看，若某企业大量依靠经营租赁开展生产经营，则资产总额相对于销售收入来说偏低，而使这类企业资产周转率被高估。
第二、担保责任引起的负债。企业有权以自己所拥有的资产，为其他主体提供担保，这种担保也是企业潜在的负债。
第三、未作记录的或有负债，依我国《企业会计准则》，除已贴现的商业承兑汇票作为资产负债表的一个附注反映外，其他或有负债，如：可能的质量事故赔偿、未决诉讼及经济纠纷等在报表中均无反映，而一旦成为事实上的负债，如企业败诉，其债务负担必然加大。
5、企业往往采用窗饰技术蒙骗会计报表使用者。一般而言，财务分析的诸多指标中，凡是以时点指标为基础计算的大都可以乔装打扮。如；企业为表现良好的偿债能力和营运能力可以在报表日前放宽信用条件，扩大销售，增加销售收；抛售短期有价证券；提前办理大额增资并偿还部分流动负债；期末压缩或延缓进货等等。
