总公司取得劳务派遣经营许可证，独立核算的分公司没有单独许可证，能否对派遣业务适用增值税差额征税？天津税务9月8日的答复明确，若总公司已经取得许可，分公司也已向所在地人力资源社会保障部门备案，分公司可按规定适用；分公司未备案的，不能仅凭总公司许可享受这一处理。
因此，独立核算、登记为增值税一般纳税人，并不是判断差额政策适用的全部条件。企业还应核对许可和备案状态，以及实际提供的服务是否属于政策规定的劳务派遣：派遣单位与劳动者建立劳动关系，劳动者被派到用工单位并接受其管理、为其工作。不能将人力资源咨询、业务外包等名称近似的服务未经核实一并纳入。
财政部、税务总局2026年第10号公告规定，在相关适用期间，一般纳税人提供劳务派遣服务，可从含税销售额中扣除代用工单位支付给派遣员工的工资、福利，以及为其办理社会保险和住房公积金的金额。这里扣除的是政策列举的项目，不能因为财务上计入人工成本，就将所有支出或服务费都作为差额扣除额。
扣除还需要合法有效凭证。公告列明相关工资福利支付记录、社会保险缴纳记录和住房公积金缴存记录等要求。企业宜把业务合同、人员清单、代付项目和支付记录对应起来，并核验申报扣除金额与实际业务是否一致；缺少规定依据时，不应先按差额申报、再将补齐资料当作当然可以成立的前提。
开票处理也须同步核对。公告要求在同一张发票上分别列明含税销售额和扣除额，并按扣除后的余额计算税额；不符合规定的，不得扣除。相关差额条款适用期间为2026年1月1日至2027年12月31日。
